在防治芝麻枯萎病时，首先可以选择具有抗病性的品种，例如宁津八筒白、巨野大歪嘴、金乡芝麻、平邑白芝麻、荣城黑芝麻和即墨杈芝麻等，这些品种能够有效抵抗病害的发生。
轮作也是关键的防治措施，推荐进行3到5年的作物轮作，以减少病害在土壤中的积累。在收获后，要及时清理病残体，减少病菌的滋生环境。
在种子处理上，为了预防病害，可以选择无病种子，或者对种子进行处理，使用0.5%的96%硫酸铜溶液浸泡30分钟，这有助于杀灭可能携带的病菌。
地下害虫也是影响芝麻健康的重要因素，因此在日常管理中，要注意防治这些害虫，以减少病害的传播途径。
采用地膜覆盖栽培技术也是一种有效的防治手段，地膜能够减少水分蒸发和土壤表层温度，从而降低病害的发生概率。
据国外报道，土壤处理使用百菌清能取得较好的防治效果，这是一种常见的防治策略，但具体实施时还需根据当地实际情况进行调整。
