钼酸铵分光光度法测总磷原理如下：
在中性条件下用过硫酸钾（或硝酸-高氯酸）使试样消解，将所含磷全部氧化为正磷酸盐，在酸性介质中，正磷酸盐与钼酸铵反应，在锑盐存在下生成磷钼杂多酸后，立即被抗坏血酸还原，生成蓝色络合物。
用钼酸铵分光光度法测定磷酸盐标准系列及测定磷酸盐标准溶液的精密度、准确度、空白检出限等，确认本实验室具备检测水质中总磷的能力。在酸性条件下，正磷酸盐与钼酸铵、酒石酸锑氧钾反应，生成磷钼杂多酸，被还原剂抗坏血酸还原，则变成蓝色络合物，通常即称磷钼蓝。
砷含量大于2mg/L有干扰， 可用硫代硫酸钠除去。硫化物含量大于2mg/L有干扰，在酸性条件下通氮气可以除去。六价铬大于50mg/L有干扰，可用亚硫酸钠除去。亚硝酸盐大于1mg/L有干扰，用氧化消解或氨磺酸均可以除去。铁浓度为20mg/L，使结果偏低5%。
铜浓度达10mg/L不干扰。氟化物小于70mg/L也不干扰。水中大多数常见离子对显色的影响可以忽略。本方法最低检出限为0.01mg/L（吸光度A=0.01时所对应的浓度） 测定上限为0.6mg/L。
水质中总磷的测定的原理：
在中性条件下，过硫酸钾溶液在高压釜内经120℃以上加热，产生如下反应：
K2S2O4+H2O→2KHSO4+[O]。从而将水中的有机磷、无机磷、悬浮物内的磷氧化成正磷酸。
在酸性介质中，正磷酸与钼酸铵反应，在锑盐存在下尘成磷钼杂多酸后，立即被抗坏血酸还原，生成蓝色的络合物，在880nm和700nm波长下均有最大吸收度。
