太阳能水泵的构造主要由几个关键部分组成，其中包括泵体、电机定子、轴、轴承以及转子水叶，即磁体和叶轮。其中，磁体采用稀土永磁材料，如钕铁硼，具有宽广的工作温度范围（-45℃至400℃），强大的矫顽力和各向异性磁场，即使在接近同极时也不会退磁，为水泵提供稳定的磁场源。
隔离件是磁力隔离泵的重要组件，当使用金属隔离套时，它会处于变化的磁场中，这会导致垂直于磁力线方向的截面产生涡电流，进而转化为热量。涡流的大小可以通过公式Pe=KnT/FD(ρσ)来衡量，其中n是泵的额定转速，T是磁传动力矩，F是隔套内的压力，D是隔套内径，ρ是材料的电阻率，σ是材料的抗拉强度。为了减少涡流，选择高电阻率和高强度的非金属材料制作隔离套是有效的策略。
轴的设计也很关键，无刷直流磁力泵通过线圈驱动转子旋转。为了保证平稳运行和降低噪音，采用高性能陶瓷轴与轴套配合，提高了旋转精度，减少了阻力和噪音。
滑动轴承部分，磁力泵通常使用工程塑料塑钢（POM）或陶瓷，这两种材料具有良好的耐热、耐腐蚀和耐磨性能。由于陶瓷材质脆且膨胀系数小，因此在选择轴承间隙时需谨慎，以避免轴承抱轴问题。滑动轴承的材质选择还需考虑输送介质的特性和使用工况。
