番茄的花是两性花，一朵花上既有雌蕊又有雄蕊，属自花授粉植物。在露地栽培条件下一般不需要进行人工授粉。在冬春保护地栽培条件下，由于棚室内通风较差，昆虫较少，不利于传粉授粉，容易造成番茄授粉不良，早期温度较低不利于坐果，这些都容易引起番茄坐果率下降或果实生长发育不良，形成畸形果，产量和品质受到影响。可以在开花初期使用2，4－D涂花或浸花，使用浓度为10～20毫克／公斤，不能喷雾，不能让药液沾到叶片上，否则易引起叶片畸形。番茄灵在每朵花序上有3～4朵花开放时喷洒，浓度为20～50毫克／公斤，每朵花处理1次。番茄开花时，用10～50毫克／公斤的赤霉素液喷花，能提高坐果率。
