亚马逊FBA库存在物流中心滞留超过365天后，除了常规仓储费外，还需支付长期仓储费。长期仓储费的计算标准为每立方英尺6.90美元，或每件商品0.15美元，取较高者。卖家可通过登录亚马逊卖家中心，进入“Inventory>Inventory Planning，下载《Inventory Age》报告或进入“Reports>Fulfillment，下载《Inventory Health》或《Recommended Removal》报告，查看每日ASIN在亚马逊物流中心的仓储日期。
亚马逊将库存仓储时间分为五个层次：0-90天、91-180天、181-270天、271-365天和365天以上。长期仓储费按“先到先售原则计算，卖家可通过在下一次库存清算日之前申请移除订单，避免支付长期仓储费。卖家需申请将库存退回或一键处置，才需支付移除订单费。
卖家可通过设置自动移除订单，在每月15日前自动移除需支付长期仓储费的库存，无需支付费用。卖家可选择移除所有仓储时间超过365天的库存，或保留某个价格标准以上的库存，支付长期仓储费仍可向Prime会员出售，提供免运费服务。
如果在库存清算日前申请移除即将产生长期仓储费的库存，产品在3个月内无法补充库存，除非现有库存不足以满足未来8周的预估销量。例如，2月15日库存清算日前移除库存，产品允许补货时间至少要到5月15日。除非移除部分库存后，现有库存不足以满足未来8周的预估销量，才可以补充库存，但inventory utilization（现有库存加上补充库存）不得超过过去90天（约13周）的销量。
举例说明，若过去90天卖出270件，则未来8周预估销量为168件（270件/90天×7×8）。若inventory utilization为155件，低于预估销量168件，卖家可以发送新的库存到亚马逊仓库，但不能超出过去90天的销量（270件），即卖家可以补充115件库存（270-155=115）。
