根：水仙为须根系，由茎盘上长出，乳白色，肉质，圆柱形，无侧根，质脆弱，易折断，断后不能再生，表皮层由单层细胞组成，横断面长方形，皮层由薄壁细胞构成，椭圆形。为外起源，老根具气道。
球茎：中国水仙的球茎为圆锥形或卵圆形。球茎外被黄褐色纸质薄膜，称球茎皮。内有肉质、白色、抱合状球茎片数层，各层间均具腋芽，中央部位具花芽，基部与球茎盘相连。
叶：中国水仙的叶扁平带状，苍绿，叶面具霜粉，先端钝，叶脉平行。成熟叶长30－50厘米，宽1－5厘米。基部为乳白色的鞘状鳞片，无叶柄。栽培的中国水仙，一般每株有叶5－9片，最多可达11片。
花：花序轴由叶丛抽出，绿色，圆筒形，中空；外表具明显的凹凸棱形，表皮具蜡粉；长20－45厘米，直径2－3毫米。伞形花序；小花呈扇形着生于花序轴顶端，外有膜质佛焰苞包裹，一般小花3－7朵（最多可达16朵）；花被基部合生，筒状，裂片6枚，开放时平展如盘，白色；副冠杯形鹅黄或鲜黄色（称金盏银台。尚有金盏金台——花瓣副冠均为黄色；银盏银台——花瓣副冠均为白色）。雄蕊6枚，雌蕊1枚，柱头3裂，子房下位。
果实：为小蒴果。蒴果由子房发育而成，熟后由被部开裂。中国水仙为三倍体，不结种实
