主要区别是，性质不同、特点不同、适用范围不同，具体如下：
一、性质不同
1、聚氨酯防水涂料
聚氨酯防水涂料是由异氰酸酯、聚醚等经加成聚合反应而成的含异氰酸酯基的预聚体，配以催化剂、无水助剂、无水填充剂、溶剂等，经混合等工序加工制成的单组分聚氨酯防水涂料。
2、橡胶沥青防水涂料
橡胶沥青防水涂料运用高分子合成技术，是新型特级橡胶防水涂料，加入了环氧树脂和树脂基团，具多功能与环保合一体的防水涂料。
二、特点不同
1、聚氨酯防水涂料
（1）、能在潮湿或干燥的各种基面上直接施工 。
（2）、与基面粘结力强，涂膜中的高分子物质能渗入到基面微细细缝内，追随型强。
（3）、涂膜有良好的柔韧性，对基层伸缩或开裂的适应性强，抗拉性强度高。
（4）、 耐候性好，高温不流淌，低温不龟裂，能耐油、耐磨、耐臭氧、耐酸碱侵蚀。
（5）、涂膜密实，防水层完整，无裂缝，无针孔、无气泡、水蒸气渗透系数小，既具有防水功能又有隔气功能。
2、橡胶沥青防水涂料
固化后成橡胶状高弹性无接缝，无接头的防水防腐层，为连续封闭体系。在顶面，平面，立面，斜面等各种干燥基面上粘接牢固。对任何形状复杂，管道纵横的部位都容易施工。
三、适用范围不同
1、聚氨酯防水涂料
适用于屋面和厕浴间、地下室、蓄水池、墙面的防水，防渗、防潮。
2、橡胶沥青防水涂料
适用各种工业，民用建筑物，屋顶，天沟，阳台，外墙，卫生间，厨房，地下室，水池，下水道，矿井，隧道，管道，桥梁灌缝，地下地上金属管道，高低温管道，保温管内外壁等防水，防潮，防腐蚀等工程。
参考资料来源：百度百科-聚氨酯防水涂料
参考资料来源：百度百科-橡胶沥青防水涂料
