穿梭式货架从表面看去有些类似于驶入式货架（贯通式货架），但与之相比，又有很多的超越之处。它们同时都使用叉车，但穿梭式货架只是用叉车把货放在穿梭货架的一头即可，随后步骤交给穿梭台车而贯通式货架则需要叉车进入货架的内部进行上货与取货的操作。这样减少或避免了对货架的可能的损害。而从存储量上，显然比重型货架、压入式货架、重力式货架有着更高的存储优势。
当然，穿梭式货架的最大的优势还是表现在它们的自动化存储模式上。而在自动化仓储领域里，相比综合性的自动化立体库，在建造成本上也更具优势，在很多的中小企业中，对于提升改造原有的，或者建造更好的存储货架系统，穿梭式货架系统在成本上相对更具有优势。在可终端控制的穿梭系统中，可根据实际情况灵活地选择先进先出或先进后出功能。而且由于其自动化的设计运行优势，非常的适合在冷库等极端仓库中的使用，以尽可能的减少人员的活动，提升实际的工作效率。
穿梭式货架的技术难点。穿梭式货架其核心部分之一是穿梭台车，这也是其实现自动化的主要部件。这样，对于它的要求就很高。由于它的运行是通过远程终端控制的，保证其通信正常、在设计距离范围内实现长期的操作就显得十分的重要。此外，穿梭车的其他部分也要协同一致，以保证整体的效果。这种科技含量高的设备的获取，就需要与一个有实力的科技公司合作完成，以保证其在货架上协同运作，适应仓库以及存货的要求。而由于该系统投资成本及后续维护成本比较高，可能需要有专业可靠的服务团队负责维修维护。
