主要区别是，科目分类不同、形态特征不同、生长习性不同，具体如下：
一、科目分类不同
1、兰花
兰花，别名中国兰、春兰、兰草、幽兰等。是微子目、兰科、兰属植物。
2、君子兰
君子兰，别名大花君子兰、大叶石蒜、剑叶石蒜、达木兰。是百合目、石蒜科、君子兰属植物。
二、形态特征不同
1、兰花
附生或地生草本，叶数枚至多枚，通常生于假鳞茎基部或下部节上，二列，带状或罕有倒披针形至狭椭圆形，基部一般有宽阔的鞘并围抱假鳞茎，有关节。总状花序具数花或多花，颜色有白、纯白、白绿、黄绿、淡黄、淡黄褐、黄、红、青、紫。
2、君子兰
根肉质纤维状，为乳白色，十分粗壮。茎基部宿存的叶基部扩大互抱成假鳞茎状。叶片从根部短缩的茎上呈二列叠出，排列整齐，宽阔呈带形，顶端圆润，质地硬而厚实，并有光泽及脉纹。伞形花序顶生，花直立，有数枚覆瓦状排列的苞片，每个花序有小花7-30朵，多的可达40朵以上。浆果紫红色，宽卵形。
三、生长习性不同
1、兰花
喜阴，怕阳光直射；喜湿润，忌干燥；喜肥沃、富含大量腐殖质；宜空气流通的环境。
2、君子兰
喜欢半阴而湿润的环境，畏强烈的直射阳光，生长的最佳温度在18-28℃之间，10℃以下，30℃以上，生长受抑制。君子兰喜欢通风的环境，喜深厚肥沃疏松的土壤，适宜在疏松肥沃的微酸性有机质土壤内生长。君子兰是著名的温室花卉，适宜室内培养。
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这两种花的特征有着根本的区别，所以它们不是同一种，前者是兰科，后者是石蒜科，它们的种属都是不一样的。所以它们是两种不一样的植物，后者压根不属于前者，很多人都会产生误解，以为前者中带有兰字，就和后者有种属关系，其实他们除了名字之外是没有关系的。
