辣椒短柱花是指辣椒花柱低于花药，花小花瘦的一类花的总称。见图39。
图39 辣椒正常花与短柱花A.花柱 B.花药 C.子房 1.长柱花 2.中柱花 3.短柱花辣椒短柱花的花柱隐藏于花药筒内，开花时，花药向下撒放花粉，花柱因位置靠上，授粉不良，坐果率低。另外，短柱花自身的发育也不良，花小花瘦，也难以正常坐果，即使坐住果，果实也大多发育不好。
短柱花产生的主要原因：一是植株生长不良，或生长过旺，发生了徒长，花芽营养供应不足而发育不良；二是花芽分化期间的温度偏高，特别是夜间的温度过高，昼夜温差较小，植株体内的营养积累不足，引起花芽分化不良；三是受病虫危害。
预防辣椒短柱花：一是培育壮苗，防止苗期徒长或形成老化苗；二是保证充足光照；三是栽培期间保证肥水供应，特别是磷肥供应；四是保持适宜的温度，防止温度偏低或过高；五是及时防治病虫害，保持植株良好的生长势。
